Пензенский «Мемориал» был основан в 2000 году: за 20 лет он издал несколько книг, провел конкурсы среди школьников, а также научно-исследовательскую работу с архивами СССР. Часть финансирования в виде грантов организация получала от областного правительства, но в 2012 году прекратила финансовую деятельность.
В 2021 году пензенский «Мемориал» объявил о своей ликвидации, при этом продолжая работать без статуса юрлица. Пензенский «Мемориал» работал как региональное отделение общероссийского «Мемориала» после того, как организация ПЕНЗЕНСКОЕ РЕГИОНАЛЬНОЕ ОТДЕЛЕНИЕ ОБЩЕРОССИЙСКОЙ ОБЩЕСТВЕННОЙ ОРГАНИЗАЦИИ «РОССИЙСКОЕ ИСТОРИКО-ПРОСВЕТИТЕЛЬСКОЕ И ПРАВОЗАЩИТНОЕ ОБЩЕСТВО „МЕМОРИАЛ“» была ликвидирована по инициативе её председательницы Татьяны Алфертьевой в 2021 году по решению суда.