«Институт социальных изменений» начал свою работу в 2008 году. Деятельность организации была связана прежде всего с развитием инклюзивного образования на Кавказе, формированием лидерских качеств у детей и подростков, а также поддержанием экологической инициативы. Кроме того, «Институт социальных изменений» объединял учителей, которые повышали квалификацию в рамках проекта «Образовательная инициатива на Северном Кавказе».
«Иностранным агентом» организация была признана осенью 2019 года. За нарушение требований законодательства об «иноагентах» «Институт социальных изменений» был оштрафован на 300 000 рублей. Руководство организации оказалось не в состоянии выплатить эту сумму. В итоге «Институт социальных изменений» прекратил свою деятельность.